Associação genômica ampla para teor de ferro em grãos de arroz na região Sul do Brasil

Oliveira, Victoria Freitas de; Venske, Eduardo; Stafen, Cássia Fernanda; Paniz, Fernanda Pollo; Pedron, Tatiana; Pereira, Rodrigo Mendes; Magalhães Júnior, Ariano Martins de; Maia, Luciano Carlos da; Oliveira, Antonio Costa de; Batista, Bruno Lemos; Pegoraro, Camila

doi:10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03203

Tabla de contenido Anterior Actual Siguiente

Genetics / Scientific Notes • Pesq. agropec. bras. 58 • 2023 • https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03203 linkcopiar

Associação genômica ampla para teor de ferro em grãos de arroz na região Sul do Brasil

Autoria SCIMAGO INSTITUTIONS RANKINGS

O objetivo deste trabalho foi mapear regiões cromossômicas responsáveis pelo acúmulo de ferro em grãos de arroz, na região Sul do Brasil. Oitenta e um acessos de arroz foram genotipados e fenotipados quanto ao acúmulo de Fe. Polimorfismos de nucleotídeos únicos foram mapeados no grão integral, nos cromossomos 1, 5, 6 e 10, dos quais 13 genes candidatos foram identificados. Alguns dos genes, como o Os10g0406800, parecem ter relação com a homeostase do Fe, enquanto outros têm relação com outros processos metabólicos ou função desconhecida.

Termos para indexação:
Oryza sativa ; arroz integral; genes candidatos; genotipagem; mapeamento

Chromosome	Gene ID	Transcript variants	Annotation	Gene Position
1	Os01g0653800	Os01t0653800-01	Similar to predicted protein; WD40 repeat-like domain containing protein.	26,457,976~26,465,951
		Os01t0653800-02		26,453,784~26,465,951
		Os01t0653800-03	Similar to Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin.	26,454,207~26,459,369
5	Os05g0296900	Os05t0296900-01	Hypothetical conserved gene.	13,229,992~13,230,715
5	Os05g0297001	Os05t0297001-01	Similar to predicted protein.	13,232,746~13,234,909
6	Os06g0133000	Os06t0133000-01	Granule-bound starch synthase 1, Synthesis of amylose in endosperm.	1,765,622~1,770,574
	Os06g0133000	Os06t0133000-02		1,766,470~1,770,653
	Os06g0133100	Os06t0133100-01	Hypothetical protein.	1,769,541~1,770,459
	Os06g0133200	Os06t0133200-01	Conserved hypothetical protein.	1,776,726~1,777,351
	Os06g0133300	Os06t0133300-00	Hypothetical conserved gene.	1,780,570~1,780,854
	Os06g0134400	Os06t0134400-01	Protein of unknown function DUF3615 domain containing protein.	1,784,324~1,784,813
	Os06g0133500	Os06t0133500-00	Conserved hypothetical protein.	1,785,455~1,785,802
	Os06g0133600	Os06t0133600-01	Phosphate-induced protein 1 Conserved region family protein.	1,789,916~1,791,294
		Os06t0133600-02		1,789,946~1,791,291
10	Os10g0406800	Os10t0406800-01	Armadillo-like helical domain containing protein.	13,919,961~13,925,636
	Os10g0406701	Os10t0406701-01	Conserved hypothetical protein.	13,908,015~13,912,718
	Os10g0406600	Os10t0406600-01	Complex 1 LYR protein family protein.	13,905,198~13,906,597

location_on

Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento; Pesquisa Agropecuária Brasileira Caixa Postal 040315, 70770-901 Brasília DF Brazil, Tel. +55 61 3448-1813, Fax +55 61 3340-5483 - Brasília - DF - Brazil
E-mail: pab@embrapa.br

rss_feed Acompañe los números de esta revista en su lector de RSS