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Ano |
Painel de SNPs |
Espécie |
Objetivo da utilização de ROHs |
Conclusões |
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Gomez-Raya et al.
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2015 |
35K |
Suína |
Obter novos coeficientes de autozigosidade baseados no tamanho e na distribuição de ROHs e compará-los com frequência de ROH (FROH) e informações de pedigree (FPED) |
Novos coeficientes de autozigosidade forneceram informações adicionais sobre consanguinidade recente |
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Howard et al.
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2015 |
54K |
Bovina |
Identificar regiões do genoma que sofreram perda de diversidade devido à consanguinidade e determinar a relação entre efeitos aditivos e ROH |
Há múltiplas regiões associadas a ROH < 4 Mb, na população estudada, tendo-se identificado correlação entre efeito genético aditivo e ROH < 4 Mb, indício de influência da localização geográfica na homozigosidade |
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Kim et al.
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2015 |
54K |
Bovina |
Identificar associação entre ROH e coeficientes de consanguinidade (F), bem como analisar as ROHs identificadas em população de bovinos leiteiros |
ROHs refletem homozigosidade fortemente influenciada por seleção artificial recente |
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Kim et al.
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2015 |
54K |
Bovina |
Identificar assinaturas de seleção em bovinos da raça Jersey sob seleção intensa desde 1960 e compará-las pelo método de identificação de assinaturas de seleção por haplótipo estendido |
A análise das ROHs estimadas possibilita a eficiente identificação de assinaturas de seleção |
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Marras et al.
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2015 |
54K |
Bovina |
Comparar FROH com coeficiente de matrizes de parentesco genômico (FGRM) e FPED, em cinco diferentes raças bovinas |
A ROH é uma ferramenta poderosa para estimar o coeficiente de consanguinidade |
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Metzger et al.
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2015 |
50K |
Equina |
Identificar assinaturas de seleção em cavalos melhorados e não melhorados |
O tamanho e a frequência de ROHs variam de acordo com a diversidade populacional e a pressão de seleção |
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Saura et al.
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2015 |
60K |
Suína |
Detectar regiões genômicas responsáveis por perda de variabilidade genética em características reprodutivas de suínos melhorados |
Estimativas genômicas baseadas na presença ou na ausência de ROHs são alternativa viável para detecção da perda de variabilidade por consanguinidade |
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Zavarez et al.
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2015 |
777K |
Bovina |
Caracterizar níveis de autozigosidade, baseado em ROHs, em população de bovinos da raça Nelore |
A análise de ROH possibilita caracterizar rebanhos quanto aos seus níveis de endogamia, além de identificar regiões do genoma com possíveis assinaturas de seleção para a raça |
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Zhang et al.
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2015 |
54K |
Bovina |
Comparar diferentes estimadores de coeficiente de consanguinidade, calculados a partir de informações de pedigree, com dados provenientes de chip de 50K SNP e de sequenciamento completo e estimativa baseada em ROH |
FROH reflete níveis diretos de homozigosidade por não ser influenciada por frequências alélicas, enquanto FPED é limitada em razão de sua dependência de informações corretas de pedigree |
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Zhang et al.
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2015 |
Genoma completo |
Bovina |
Estudar padrões de ROH para verificar o efeito da pressão de seleção e da demografia no aumento da frequência de sequências deletérias e não deletérias dentro de ROHs |
A ROH é eficiente para detectar variantes funcionais em populações de bovinos, e contribui para melhor compreensão dos efeitos da endogamia e da seleção nessas populações |
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Mastrangelo et al.
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2016 |
54K |
Bovina |
Quantificar a consanguinidade a partir de informações de ROHs estimadas em três diferentes raças bovinas de importância econômica |
Valores de consanguinidade em três raças de bovinos, a partir da detecção e da distribuição de ROHs, evidenciaram a necessidade da implementação de programas de conservação com vistas ao controle dos níveis de consanguinidade |
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Gurgul et al.
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2016 |
54K |
Bovina |
Comparar FROH, FGRM e FPED, testar a correlação entre esses coeficientes, e analisar se ROH ou GRM pode ser interessante para estimar consanguinidade recente em gado holandês |
Correlações entre FROH e FPED tendem a aumentar com o aumento de informações de pedigree, e são indicativas de que FROH é mais indicada para estimar consanguinidade recente |
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Szmatoła et al.
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2016 |
54K |
Bovina |
Caracterizar ROH em quatro diferentes raças bovinas e identificar regiões do genoma com alta frequência de ROH que tenham sofrido ação de seleção direcional |
O tamanho e a distribuição de ROHs variam de acordo com a raça estudada, com padrões de ROH diferentes para raças nativas, conservadas ou comerciais, e possíveis assinaturas de seleção |
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Reverter et al.
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2017 |
729K 71K 19K |
Bovina |
Comparar FGRM, coeficiente de homozigosidade (FHOM) e FROH como estimadores de consanguinidade, com uso de dados de três densidades de painéis distintas em zebuínos |
Em populações heterogêneas (animais cruzados), medidas de endogamia não dependentes da frequência alélica, como FHOM e FROH, são mais indicadas para estimar a endogamia |