A Organização Mundial da Saúde declarou a disseminação generalizada do SARS-CoV-2 e sua doença associada (COVID-19) uma emergência de saúde pública. O teste padrão ouro para detecção do vírus é o RT-PCR, realizado a partir de amostras de swab nasofaríngeo (NPS). No entanto, esse exame pode ser desconfortável para o paciente e requer treinamento específico e vestimenta do profissional de saúde responsável pela coleta da amostra. Portanto, a busca por formas alternativas de coleta de amostras que possam ser utilizadas no diagnóstico de COVID-19 é relevante. O objetivo deste estudo foi comparar os resultados obtidos em amostras de NPS e saliva. Amostras de NPS e saliva foram coletadas de 189 pacientes ambulatoriais sintomáticos com suspeita de COVID-19, que procuraram a Policlínica Piquet Carneiro. A extração de RNA foi realizada com o kit Bio-Gene DNA / RNA Viral Extraction (Bioclin®) e as reações em tempo real da reação em cadeia da polimerase-transcriptase reversa (RT-PCR) usaram o kit Molecular SARS-CoV-2 (E / RP) (Bio-Manguinhos). Os resultados indicaram que 142 apresentaram resultado não detectável (ND), enquanto 47 apresentaram resultado detectável (D). Entre os 142 "ND", 137 (94,4%) amostras de saliva obtiveram o mesmo resultado, enquanto 5 amostras (3,4%) foram "D". Dentre as 47 amostras de swab "D", 35 (74,4%) apresentaram o mesmo resultado nas amostras de saliva. A sensibilidade do teste de saliva foi de 0,74 e a especificidade foi de 0,97. O valor preditivo positivo foi de 0,88, enquanto o valor preditivo negativo foi de 0,92. Os resultados mostraram que a detecção de Sars-CoV-2 em amostras de saliva apresentou alta sensibilidade e especificidade quando comparada com swabs nasofaríngeos.
Article • Braz. Dent. J. 33
(2)
• Mar-Apr 2022 • https://doi.org/10.1590/0103-6440202204591 linkcopiar
SARS-COV-2 detection in saliva and nasopharyngeal swabs using RT-PCR was similar
Autoria
person Taísa Coelho Guimarães
person Barbara Bruno Fagundes Marques
person Justine Monteiro Monnerat Tinoco
person Luís Cristóvão Moraes Sobrino Porto
schoolHistocompatibility and Cryopreservation Laboratory, Rio de Janeiro State University, BrazilRio de Janeiro State UniversityBrazilBrazilHistocompatibility and Cryopreservation Laboratory, Rio de Janeiro State University, BrazilschoolClinical Pathology Service, Piquet Carneiro Policlinic, Rio de Janeiro State University, BrazilRio de Janeiro State UniversityBrazilBrazilClinical Pathology Service, Piquet Carneiro Policlinic, Rio de Janeiro State University, Brazil
person Eduardo Muniz Barretto Tinoco
person Ricardo Guimarães Fischer
Correspondence: Ricardo Guimarães Fischer - Dental School; Rio de Janeiro State University, Boulevard 28 de Setembro, 157; Vila Isabel, Rio de Janeiro, RJ, Brazil; CEP- 20551-030, E-mail: ricardogfischer@icloud.com
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Tabelas
table_chartTable 1
SARS Covid-19 RT-PCR from nasopharyngeal (NPS) and saliva samples in symptomatic outpatients.
| NP swabs | Total | |||
|---|---|---|---|---|
| Positive | Negative | |||
| Saliva samples | Positive | 35 | 5 | 40 |
| Negative | 12 | 137 | 149 | |
| Total | 47 | 142 | 189 | |
table_chartTable 2
Mean (± SD) of age, gender distribution, and frequency of symptoms in outpatients with positive and negative nasopharyngeal samples (NPS) to detect COVID-19.
| Total (n=189) | NPS + (n=47) | NPS - (n=142) | p value | |
|---|---|---|---|---|
| Age | 39.2 (±11.5) | 39.5 (±12) | 38.1 (±9.8) | 0.45 |
| Gender female n (%) | 141 (74.6) | 34 (72.3) | 107 (74) | 0.7 |
| Smoking yes n (%) | 11 (5.8) | 0 (0) | 11 (7.7) | 0.17 |
| Unwellness yes n (%) | 146 (77.2) | 42 (89.4) | 104 (73.2) | 0.02 |
| Cough yes n (%) | 128 (67.7) | 33 (70.2) | 95 (67) | 0.67 |
| Loss of smell and/or taste n (%) | 71 (37.5) | 26 (55.3) | 45 (31.7) | 0.003 |
| Abdominal pain yes n (%) | 70 (37) | 18 (38.3) | 52 (36.6) | 0.83 |
| Fever yes n (%) | 86 (45.5) | 30 (63.8) | 56 (39.4) | 0.003 |
-
NPS +: individuals who tested positive on the NPS test;
-
NPS -: individuals who tested negative on the NPS test.
-
p-value: differences among positive and negative samples
table_chartTable 3
Mean (± SD) of age, gender distribution, and frequency of symptoms in outpatients with positive and negative saliva samples to detect COVID-19.
| Total (n=189) | saliva + (n=40) | Saliva - (n=149) | p value | |
|---|---|---|---|---|
| Age | 39.2 (±11.5) | 38.3 (±10.2) | 39.4 (±11.8) | 0.6 |
| Gender Female n (%) | 139 (73.5) | 30 (75) | 109 (73.2) | 0.8 |
| Smoking n (%) | 11 (5.8) | 0 (0) | 11 (7.4) | 0.26 |
| Unwellness n (%) | 149 (78.8) | 36 (90) | 110 (73.8) | 0.03 |
| Cough n (%) | 128 (67.7) | 26 (65) | 102 (68.5) | 0.67 |
| Loss of smell and/or taste n (%) | 71 (37.6) | 20 (50) | 51 (34.2) | 0.06 |
| Abdominal pain n (%) | 70 (37) | 15 (37.5) | 55 (36.9) | 0.95 |
| Fever n (%) | 86 (45.5) | 24 (60) | 62 (41.6) | 0.03 |
-
Saliva +: individuals who tested positive on the saliva test.
-
Saliva -: individuals who tested negative on the saliva test.
-
p-value: differences among positive and negative samples
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